类风湿研究院(类风湿关节炎临床科研谁家强?)
本期关键词:类风湿关节炎;大数据分析;引用
(Credit: SCIENCE PHOTO LIBRARY/SCIENCE SOURCE; From NEJM)
类风湿关节炎(rheumatoid arthritis, RA)主要临床表现为小关节滑膜所致的关节肿痛,继而软骨破坏、关节间隙变窄,晚期因严重骨质破坏、吸收导致关节僵直、畸形、功能障碍;导致患者丧失生理功能、无法完成日常生活活动。
更可怕的是,RA会反复复发,并且复发的时间和严重程度完全不可预测。
我们在上周推送了美国风湿免疫学家Orange等发表在新英格兰医学杂志(NEJM)上的研究,类风湿关节炎发作前1至2周,患者血液中CD45-CD31-PDPN +炎症前间充质细胞(PRIME)显著增高。这些细胞的出现可以预测患者RA发作,如果以这些细胞作为治疗靶点,很可能由此预防RA发作。
【NEJM】医生找到预测类风湿关节炎复发的关键细胞
推文发出后,后台收到很多留言,最多的是想知道,“中国的临床科研目前处于什么状况?”。
对于这个问题,作为小专业外人员,肯定是不敢回答。但是我们仍然可以从中国学者发表的SCI论文情况,窥得一斑。
也恳请专家们批评指正,以求更准确。
检索词:
((rheumatoid[Ti]) AND (arthritis[Ti])) OR (rheumatoidarthritis[MeSH Terms])
检索数据库:Medline
检索工具:文献鸟
检索报告主要分为三部分:
第一部分是big analysis(大数据分析),也就是对发表论文的宏观分析,包括发表年度、国家/地区、杂志、作者、关联领域、最常发表的杂志等等。
第二部分是citation network,是已经发表论文的被引用情况。我们都知道,论文的价值体现在被阅读和借鉴,并通过被引用次数体现出来。所发表影响因子越高、及被引用越多,则该论文被定义为越有影响力的论文。
第三部分是美国国立卫生研究院立项初检结果。NIH除了有最庞大的科研院所之外,还负责管理生物医学领域的科研立项。
下面依次展开。
第一部分:类风湿关节炎研究论文大数据分析。
如下是所有文献的时间和国家分布图
(论文的时间和国家分布)
时间分布显示,针对类风湿关节炎研究,目前已发表121,161篇SCI,其中纳入到本次分析的有10,000篇,主要集中在2017 -2020年;所以本推文分析也主要基于最近3年的论文。
总体看,类风湿关节炎研究持续受到关注,热度值为50。
国家分布可以看到,中国发表的类风湿关节炎论文数量仅次于美国,居第二位;日本、荷兰、意大利和法国分列第三到六位。
类风湿关节炎领域
发文最多学术机构排名
(发表论文的机构排名)
可以看到Leiden 大学医学中心(荷兰)遥遥领先、曼彻斯特大学(英国)和安徽医科大学(中国)分列论文发表数量的二、三名。
我们特意标记出了上榜的中国研究机构,可以看到除了安徽医科大学之外,还有北京大学人民医院、南方医科大学、四川大学、北京大学第一医院、中国医科大学和中南大学等机构上榜。
继续查看类风湿关节炎研究相关的热点基因和相关疾病
(研究热点基因和课题)
TNF、STAT3、HLA-DRB1、ACR等是类风湿关节炎研究中最受关注的基因;而关节炎、狼疮等是与类风湿关节炎最相关的关键词/研究热点。
上述列表对于选题有非常好的参考价值。
发表类风湿关节炎最多的杂志
(发表论文的杂志分布)
发表类风湿关节炎相关研究最多的杂志中依次是:Clin Rheumatol (IF 2.4), Ann Rheum Dis (IF 16.1), Rheumatology (Oxford) (IF 5.6), Clin Exp Rheumatol (IF 3.3), Arthritis Res Ther (IF 4.1)等。
杂志后面附有影响因子,参考这个排名及影响因子,对于投稿有非常强的参考价值。
类风湿关节炎研究领域知名学者学术圈,及其关系网。
(学术大咖及其关系网)
本编辑对这个领域不是很熟悉,但根据本图可以看到,最近一年半中,领域内最重要的学者包括奥地利的Smolen, Josefs、日本的Takeuchi, Tsutomu、法国的Mariette, Xavier、英国的Emery, Paul等。
其中Smolen, Josefs不仅仅影响力最大,还处于非常核心的位置,与其他知名学者有广泛的联系。
上面关系网中的学者,是怎么筛出来的呢?
是基于学者在该领域的论文影响因子总分。
(学术大咖排名)
与网络图中的学者相对应,按照影响力展示学者排名。可以看到,类风湿关节炎研究领域较活跃的中国学者中,有北京大学第一医院的Zhang, Zhuoli,北京大学人民医院的Li, Zhanguo和安徽医科大学的Wei, Wei等学者。
果然,知名学者和知名研究中心相互成就。
我们一起学习专家们的贡献。
第一位,奥地利的Smolen, Josefs,最近3年发表了31篇SCI论文,主要侧重于类风湿关节炎的新药研发和治疗。
北京大学第一医院的Zhang, Zhuoli,近三年发表了21篇SCI论文,主要关注类风湿关节炎的治疗达标和降低复发研究。
北京大学人民医院的Li, Zhanguo,近三年发表18篇SCI论文,侧重于类风湿关节炎生物标记和干预靶点的研究。
安徽医科大学的Wei, Wei,近三年发表23篇SCI论文,侧重于类风湿关节炎发病机制的研究。
根据这个大数据分析,在短时间内对类风湿关节炎的热点和知名研究机构和学者都有了系统的了解。
要想通晓一个领域、尤其是最新进展,经典和重要论文是必读的。
第二部分:找到类风湿关节炎最近一阶段最有影响的论文。
通过“citation network”功能,可以看到所有10,000篇文献的分布。
每个点都是一篇文献,左边的是最早发表的;点的大小代表着这篇论文的影响力,即被引用次数。
(被引用排名)
我们再看领域内前1%的论文。
有了这些,新人就容易知道,开题报告或基金申请书的立项依据部分,或论文的前言和讨论部分,该读和该引哪篇文章了。
而顺着论文关系网,你也更容易捋清这些研究的承接图,对于自己设计课题非常重要。
如果点击任何一篇文献,都会出现该文献的信息。
如下,点击代表论文的小点,可以打开该文献的页面,查看标题(大部分有摘要)。以及Pubmed及其他页面链接。
(文献链接)
还可以通过列表读到这些经典论文的具体细节;论文按照影响力排列。
(名单很长,只列出被引用最有影响力的论文排名)
很遗憾的是,在最有影响力论文中,来自中国大陆的论文难觅踪迹。
第三部分:
研究动态实时更新
了解了类风湿关节炎最知名学者、研究机构,也知晓了领域内的经典论文及其发表杂志,顿时感觉“腹有诗书气自华”,腰板挺直了很多。
但是,这些只是存量知识。而未来需要创造。知识的实时更新,及时获得最新研究进展非常重要。
我们也可以一窥NIH资助的部分基金。
(NIH在研课题检索)
对于美国资助的类风湿关节炎研究,我们以后会做过专门的分析。
总结:
通过大数据分析,获取了类风湿关节炎领域的研究热点领域和基因、研究机构和知名专家,这些研究发表的杂志,以及该领域的经典论文和美国NIH资助课题情况。
不仅有助于快速系统了解该领域,对于课题选题及课题设计、选取合适的投稿杂志都提供了非常有价值的参考。
1)在最近的3年时间里,就已经有1万多篇SCI论文发表;
2)就单一机构来说,中国的安徽医科大学发表的SCI总数第三;
3)我们可以看到有中国大陆学者进入到最有影响力学者之列。
4)但中国大陆研究论文在最有影响力论文中难以觅到;
5)作为临床常见但远未解决的疾病,目前的研究仍偏重于临床治疗和复发的预防。
补:
按照我们的格式,本推文到此本应该结束。可是,本文作者心里很难受;因为没有看到北京协和医院的任何信息。我得承认,这存在非常大的漏检可能。
为了验证这一点,我对北京协和医院和北京大学人民医院发表的SCI进行了比较。
下图中蓝色是北京协和医院发表在类风湿关节炎方面的SCI论文,红色代表北京大学人民医院发表的SCI论文。